南京公司注销的流程和所需材料如下：
前期准备：公司股东会或董事会需要做出注销决议，成立清算组，并拟定清算方案。在国家企业信用信息公示系统和《南京日报》等指定报纸上发布清算公告，等待45天，让债权债务人都知道1。
税务注销：准备好公章、执照副本、发票相关资料、税控设备等，前往税务局办理税务注销，完税后拿到《税务注销通知单》1。
工商注销：公示期满后，携带申请书、决议、身份证复印件、执照、税务注销单等材料前往工商局，领取《准予注销登记通知书》1。
银行账户注销：凭工商注销证明等材料前往开户银行，注销公司银行账户1。
社保、公积金账户注销：按照社保局和公积金管理中心的要求，备齐材料办理社保和公积金账户的注销1。
印章注销，拿着工商注销通知书等材料前往公安机关注销印章1。
南京公司简易注销的流程如下：
清税证明：前往税务部门清税，并开具清税证明凭证2。
公示系统填报：登录国家企业信用信息公示系统，进行企业信息填报2。
发布简易注销公告：发布简易注销公告，等待20天公示期2。
提交材料：公示期满后，携带全体投资人承诺书原件、清税证明、营业执照、注销申请书、公章等材料到窗口办理注销手续
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